巴西和德國科學(xué)家完成了一項(xiàng)合作項(xiàng)目，對巨型淡水魚Arapaima gigas的全基因組進(jìn)行測序和分析，這種巨型淡水魚在巴西被稱為pirarucu，在其他地方被稱為Arapaima或paiche。它的生長速度是已知淡水魚中最快的。它的自然分布覆蓋了秘魯和巴西的大部分亞馬遜河流域。
這項(xiàng)研究有助于早期性別決定的發(fā)現(xiàn)，并促進(jìn)了雌雄魚苗的性別特異性繁殖和銷售。這也為進(jìn)一步研究該物種的遺傳改良鋪平了道路。這項(xiàng)研究的結(jié)果得到了FAPESP的支持，并發(fā)表在一份科學(xué)報告中。
合作始于2015年，當(dāng)時德國維爾茨堡大學(xué)的遺傳學(xué)家曼弗雷德沙爾特聯(lián)系了生物學(xué)家拉斐爾恩里克諾布雷加和當(dāng)時的博士生馬科斯安東尼奧德奧利維拉。奧利維拉在巴西博托卡的圣保羅州大學(xué)水產(chǎn)養(yǎng)殖中心獲得博士學(xué)位。
Nbrega是該大學(xué)生物科學(xué)研究所(IB-UNESP)的教授，他提議合作研究巨蜥的性別決定和分化機(jī)制。Nbrega說：“它是世界上最大的淡水魚，也是亞馬遜的標(biāo)志性物種，具有相當(dāng)大的經(jīng)濟(jì)價值，所以Schartl很驚訝它的基因組在當(dāng)時還不為人所知，基因標(biāo)記也沒有被確定用于性別決定。
Nbrega解釋說，青少年沒有與性別相關(guān)的次級表型差異，因此在早期發(fā)育過程中，不能通過形態(tài)學(xué)來區(qū)分男性和女性。關(guān)于性別決定和分化機(jī)制的信息是巴西水產(chǎn)養(yǎng)殖業(yè)的重要發(fā)展。
Schartl和他的團(tuán)隊(duì)專門研究魚類的性別決定基因，并了解這種豐富多樣的脊椎動物種群的性別分化機(jī)制。
青春期前的早期性別決定是研究魚類生殖周期的關(guān)鍵步驟，此時雄性和雌性在形態(tài)和表型上發(fā)生分化。
提高知識
基因組草圖A. Oyster由帕拉和里奧格蘭德聯(lián)邦大學(xué)的研究人員于2018年9月在其他機(jī)構(gòu)之間發(fā)表。
Nbrega、Oliveira和合作者最近的測序?qū)е铝伺c巨人癥和快速生長特征相關(guān)的重要遺傳發(fā)現(xiàn)。這也說明物種的性別決定和分化與XY染色體的性別決定系統(tǒng)是相容的。
這項(xiàng)研究得到了圣保羅研究基金會FAPESP的支持，并通過了對諾布雷加的常規(guī)資助，授予奧利維拉博士學(xué)位。
Nbrega說：“雖然巨噬細(xì)胞沒有可以通過組織細(xì)胞分析進(jìn)行細(xì)胞學(xué)檢測的異型染色體，但我們只鑒定了支持XY染色體性別決定系統(tǒng)存在的男性標(biāo)記。
2015年，奧利維拉前往巴西北部阿克里州里奧布蘭科附近的塞納多吉奧馬德一個名為peixesdamazonia的養(yǎng)魚場，從60只成年魚(30只公魚和30只母魚)身上采集了數(shù)十億條魚片。
這些材料被送到沙爾特的實(shí)驗(yàn)室，在那里從60個樣本中的每一個樣本中提取了脫氧核糖核酸。隨后，雷恩、圖盧茲國家農(nóng)業(yè)研究所和蒙彼利埃大學(xué)的研究人員在法國對DNA進(jìn)行了測序。
“獲得了男性和女性不同大小的基因組。男性基因組有6.66億個堿基對，而女性基因組有6.64億個。隨著魚類基因組的進(jìn)入，它們都非常小，只有人類基因組的五分之一大小，有30億個堿基對，”O(jiān)liveira說。
將巨型龍魚的基因組與另一種多骨舌(亞洲龍魚)的基因組進(jìn)行比較，這是唯一一種基因組測序的龍魚。并與歐洲鰻鱺、大西洋鱈魚、尼羅羅非魚、紅鰭東方鲀、斑馬魚和原始腔棘魚等10種不同目魚類的基因組進(jìn)行了比較。)，它們發(fā)展于4億年前，此后幾乎沒有變化。
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