柏林查理特大學和弗朗西斯克里克研究所的研究人員開發(fā)了一種基于質(zhì)譜的技術,可以在幾分鐘內(nèi)測量包含數(shù)千個蛋白質(zhì)的樣本。它比傳統(tǒng)的血細胞計數(shù)更快、更便宜。為了證明這項技術的潛力,研究人員使用了從新冠患者身上采集的血漿。他們利用新技術鑒定了11種以前未知的蛋白質(zhì),這些蛋白質(zhì)是疾病嚴重程度的指標。研究成果已在《自然生物技術》發(fā)表。
在任何給定的時間,成千上萬的蛋白質(zhì)在人體內(nèi)活躍,提供它們的結構,并使生命的基本反應得以實現(xiàn)。人體可以根據(jù)需要增加和減少特定蛋白質(zhì)的活性水平,包括對病原體和藥物等外部因素做出反應時。因此,在細胞、組織和血液樣本中發(fā)現(xiàn)的蛋白質(zhì)的詳細模式可以幫助研究人員更好地理解疾病或做出診斷和預后。為了獲得這種“蛋白質(zhì)指紋”,研究人員使用了質(zhì)譜儀,這是一種耗時且昂貴的技術?;谫|(zhì)譜的新技術掃描小水線面雙體船有望改變這種狀況。這項技術是在查理特生物化學研究所所長馬庫斯拉爾澤教授的領導下開發(fā)的。
“為了改變這項技術,我們改變了質(zhì)譜儀的電場。生成的數(shù)據(jù)非常復雜,人類無法再對其進行分析?!睈垡蛩固沟牧_勒教授說,他也是弗朗西斯大學的校長。倫敦克里克學院。他補充道:“因此,我們開發(fā)了基于神經(jīng)網(wǎng)絡的計算機算法,并利用這些數(shù)據(jù)提取相關的生物信息。這使我們能夠并行識別數(shù)千個蛋白質(zhì),并大大減少了測量時間。幸運的是,這種方法有更多的優(yōu)勢。準確?!?
這項高通量技術具有廣泛的潛在應用,從基礎研究和大規(guī)模藥物開發(fā)到生物標志物鑒定,可用于估計每個患者的風險。研究人員對新冠的研究證明了這項技術對后者的適用性。作為這項研究的一部分,研究小組分析了30名不同嚴重程度的新冠住院患者的血漿樣本,并將獲得的蛋白質(zhì)模型與15名健康個體的蛋白質(zhì)模型進行了比較。單個樣品的實際測量只需幾分鐘。
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