由慕尼黑工業(yè)大學領導的一個由 37 名科學家組成的研究小組開發(fā)了一種方法，可以以時間和劑量依賴的方式檢測藥物誘導的翻譯后修飾 (PTM)。
這項發(fā)表在《科學》雜志上的研究詳細介紹了一種方法，該方法更接近地模擬藥物蛋白與細胞中的蛋白質相互作用時細胞中發(fā)生的情況。翻譯后修飾 (PTM) 是影響蛋白質結構和動力學的處理事件。
由于蛋白質的結構與其功能相關，因此修飾可以顯著改變生物過程，這也是大多數藥物設計的運作方式。雖然藥物/細胞蛋白相互作用已廣為人知，但這種相互作用在治療過程中究竟如何發(fā)生(時間和劑量依賴性)仍是一個未被充分研究的方面。
稱為 decryptM 的蛋白質組學分析方法涉及用濃度不斷增加的藥物處理細胞并量化數以千計的藥物 PTM 以揭示目標參與和藥物作用機制。
在這項研究中，decryptM 分析應用于13 種細胞系中的 31 種抗癌藥物。來自該方法的數據代表了 180 萬個具有劑量反應曲線的定量細胞藥物測定，其中在 11,982 種蛋白質上檢測到 124,660 種調節(jié)磷酸肽，在 3,006 種蛋白質上檢測到 9,173 種泛素化肽，在 1,377 種蛋白質上檢測到 2,478 種調節(jié)乙?；?。
大多數 PTM 不受大多數??藥物的監(jiān)管，這是了解每種藥物正在使用或可能遺漏哪些途徑的寶貴信息。
對于兩種蛋白酶體抑制劑藥物硼替佐米和卡非佐米，decryptM 數據顯示藥物作用隨著時間的推移變得更加有效，并表明調節(jié)磷酸化位點的增加是一種可能的機制。
該研究還發(fā)現，不同的組蛋白脫乙酰酶抑制劑(抗癌劑)具有不同的激活時間，并且藥物的特定靶點比其他藥物更有效。這種類型的信息可以極大地有益于尋求提高現有藥物有效性的研究人員。
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