免疫療法，例如免疫檢查點(diǎn)抑制劑，已經(jīng)改變了晚期癌癥的治療。與殺死癌細(xì)胞的化學(xué)療法不同，這些藥物可幫助人體的免疫系統(tǒng)自行發(fā)現(xiàn)并摧毀癌細(xì)胞。不幸的是，只有一部分患者對(duì)免疫檢查點(diǎn)抑制劑有長(zhǎng)期反應(yīng)——而這些治療方法的成本很高，而且有副作用。
研究人員開(kāi)發(fā)了一種兩步方法，使用全外顯子組測(cè)序?qū)㈩A(yù)測(cè)癌癥患者是否會(huì)對(duì)免疫療法產(chǎn)生反應(yīng)的基因和途徑歸零。該研究發(fā)表在《自然通訊》雜志上，由紐約大學(xué)、威爾康奈爾醫(yī)學(xué)中心和紐約基因組中心的研究人員進(jìn)行，闡明了使用全外顯子組測(cè)序如何比目前的實(shí)驗(yàn)室測(cè)試更好地預(yù)測(cè)治療反應(yīng)。
“我們能更好地預(yù)測(cè)誰(shuí)將從免疫療法中受益嗎?科學(xué)家們已經(jīng)開(kāi)發(fā)出各種生物標(biāo)志物來(lái)幫助預(yù)測(cè)免疫療法的治療反應(yīng)，但仍然需要一個(gè)強(qiáng)大的、臨床實(shí)用的預(yù)測(cè)模型，”紐約大學(xué)生物學(xué)助理教授 Neville Sanjana 說(shuō)，紐約大學(xué)格羅斯曼醫(yī)學(xué)院神經(jīng)科學(xué)和生理學(xué)助理教授，紐約基因組中心核心教員，該研究的共同資深作者。
已知一些生物標(biāo)志物——包括年齡、腫瘤類(lèi)型和癌細(xì)胞中發(fā)現(xiàn)的突變數(shù)量(稱(chēng)為腫瘤突變負(fù)荷)與對(duì)免疫療法的反應(yīng)相關(guān)。通過(guò)分析數(shù)百個(gè)基因計(jì)算出的腫瘤突變負(fù)擔(dān)是最完善的預(yù)測(cè)因子，通常用于確定患者是否有資格使用免疫檢查點(diǎn)抑制劑。
如果科學(xué)家研究我們基因的更大部分，這是否有助于更好地預(yù)測(cè)哪些患者會(huì)對(duì)免疫療法產(chǎn)生反應(yīng)?全外顯子組測(cè)序是一種對(duì)編碼蛋白質(zhì)的基因組部分進(jìn)行測(cè)序的方法——大約 20,000 個(gè)基因，或基因組的 2%——以尋找可能與疾病有關(guān)的突變。
雖然全外顯子組測(cè)序并未廣泛用于癌癥治療，但最近的一些免疫療法研究已開(kāi)始包括測(cè)序。這些研究規(guī)模雖小，但共同有助于闡明基因組因素與患者對(duì)免疫療法的反應(yīng)之間的關(guān)系。
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