研究DNA重排了解癌癥

基因組的結(jié)構(gòu)變異可能是由于從數(shù)千個遺傳密碼字母到整個染色體的基因組片段的刪除、擴(kuò)增或重新排序而產(chǎn)生的。由于這些變體的復(fù)雜機(jī)制，以前很難對它們進(jìn)行分類。EMBL團(tuán)隊的負(fù)責(zé)人、泛癌癥項目的發(fā)起人和協(xié)調(diào)人之一簡科貝爾解釋說：“在這項研究中，我們發(fā)現(xiàn)了癌癥基因組重排的不同方法，并對其進(jìn)行了分類。我們首次對結(jié)構(gòu)進(jìn)行了詳細(xì)分類，并對癌癥基因組的變異機(jī)制進(jìn)行了探討?！毖芯咳藛T發(fā)現(xiàn)了幾種可能導(dǎo)致癌癥的新過程，例如，基因組的某些部分被復(fù)制不止一次的復(fù)雜過程。這可能會導(dǎo)致癌癥基因變得活躍，

將事件與突變聯(lián)系起來。

哥本哈根生物技術(shù)研究和創(chuàng)新中心的負(fù)責(zé)人、EMBL科貝爾研究小組的前博士后研究員約阿希姆韋森費(fèi)爾德說：“過去，大多數(shù)研究都是在編碼1-2%的基因組上進(jìn)行的。”“結(jié)構(gòu)變異在很大程度上被忽略了，因為它們大多位于基因組的非編碼部分，理解起來要復(fù)雜得多。”

Weischenfeldt和他的同事開發(fā)了一種通過全基因組測序分析泛癌數(shù)據(jù)來識別結(jié)構(gòu)變異及其形成機(jī)制的方法。Weischenfeldt說：“這篇論文是第一批對癌癥基因組中非常復(fù)雜的結(jié)構(gòu)變異類型進(jìn)行系統(tǒng)分類并將其與形成機(jī)制聯(lián)系起來的論文之一?！薄八F(xiàn)在使我們能夠區(qū)分癌癥基因組中不同類型的結(jié)構(gòu)變異。我們可以將它們用作不同癌癥的生物標(biāo)志物，因為一些非常有效的驅(qū)動基因的突變會導(dǎo)致特定類型的結(jié)構(gòu)變異?！鄙飿?biāo)記是生物標(biāo)記，如特定的分子或遺傳序列，可用于識別某些疾病，在這種情況下，是癌癥。

這篇論文讓研究人員更接近于回答一些關(guān)于癌癥的基本問題，因為他們現(xiàn)在可以探索基因組重排背后的遺傳學(xué)。復(fù)雜的事件可以鏈接回特定的突變，這對于更好地診斷患者非常重要。該目錄可用于預(yù)后和治療。

一種新的治療工具

Weischenfeldt解釋說，這種分析已經(jīng)被用作識別突變特征的臨床工具。具有特征模式的突變組合。Weischenfeldt目前在哥本哈根生物技術(shù)研究和創(chuàng)新中心工作，正在使用這些分析方法來了解癌癥患者的遺傳學(xué)，并設(shè)計更好、更有針對性的治療方案。他說：“我們有一個程序，使患者能夠根據(jù)基因組發(fā)現(xiàn)獲得準(zhǔn)確的藥物。本文將要發(fā)布的分類方法將成為我們工具箱的重要組成部分?！?

Weischenfeldt解釋說，泛癌癥項目訓(xùn)練了他和他的許多同事處理和分析大型和復(fù)雜的數(shù)據(jù)集，以識別復(fù)發(fā)和生物學(xué)相關(guān)的模式。他說：“起初，這些方法并不多。我們必須想出新的、可重復(fù)的研究方法來分析我們擁有的遺傳信息。”“這是一個巨大的挑戰(zhàn)，但也是一個非常激動人心的挑戰(zhàn)。這就是我們進(jìn)行研究的原因。”

科貝爾補(bǔ)充說，對EMBL科學(xué)家來說，跟進(jìn)這篇論文中提出的研究將非常有趣?？曝悹栒f：“對我們來說，下一步非常重要的是確定所有這些獨立過程的分子原因?！?

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