導讀 由遺傳學系助理教授劉青云博士領導的一項新研究發(fā)現(xiàn)了一種被稱為轉錄可塑性的遺傳特征，它在控制分枝桿菌對應激條件的轉錄反應中發(fā)揮著關鍵...
由遺傳學系助理教授劉青云博士領導的一項新研究發(fā)現(xiàn)了一種被稱為“轉錄可塑性”的遺傳特征，它在控制分枝桿菌對應激條件的轉錄反應中發(fā)揮著關鍵作用。
細菌細胞必須迅速調節(jié)其基因的表達，以應對外部環(huán)境的突然變化。然而，某些基因在多大程度上可以響應環(huán)境變化而改變其表達，而不是維持穩(wěn)定的表達水平，長期以來一直困擾著科學家。了解細菌如何調節(jié)這些不同的轉錄過程及其背后的遺傳特征仍然是一個挑戰(zhàn)。
首席研究員劉清云博士與北卡羅來納大學教堂山分校、哈佛大學和復旦大學的研究人員合作，著手解開結核分枝桿菌 (Mtb) 轉錄反應的復雜因素，結核分枝桿菌是導致結核病的細菌病原體。結核病仍然是單一傳染源導致死亡的主要原因，每年有超過 1060 萬新病例和 160 萬人死亡。
他們的研究題為“結核分枝桿菌應激適應的基因編碼轉錄可塑性”，發(fā)表在《自然通訊》雜志上。
研究人員分析了一個綜合數(shù)據集，其中包含來自 73 個不同條件的 894 個 RNA-Seq 樣本，這些樣本是在之前的研究中生成的，并由研究人員出于薈萃分析的目的而整理。
研究人員研究了結核分枝桿菌每個基因的轉錄可塑性(TP)，作為基因表達響應環(huán)境變化的變異性的代表。他們的分析揭示了 Mtb 基因之間顯著的 TP 變異，與基因功能和必要性相關。此外，他們發(fā)現(xiàn)關鍵的遺傳特征，如基因長度、GC 含量和操縱子大小，獨立地對 TP 施加限制，超出了反式調節(jié)的范圍。
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