UVA Health 研究人員開(kāi)發(fā)了一種重要的新工具，可幫助科學(xué)家在探索癌癥和其他疾病的遺傳原因時(shí)從噪音中區(qū)分信號(hào)。除了推進(jìn)研究和可能加速新療法之外，新工具還可以通過(guò)使醫(yī)生更容易檢測(cè)癌細(xì)胞來(lái)幫助改善癌癥診斷。
由 UVA 的 Chongzhi Zang 博士及其團(tuán)隊(duì)和合作者開(kāi)發(fā)的新工具是一種數(shù)學(xué)模型，將有助于確保關(guān)于我們?nèi)旧w構(gòu)建塊的“大數(shù)據(jù)”的完整性，遺傳物質(zhì)稱為染色質(zhì)。染色質(zhì)——DNA 和蛋白質(zhì)的組合——在指導(dǎo)我們基因的活動(dòng)中起著重要作用。當(dāng)染色質(zhì)出錯(cuò)時(shí)，它可以將健康細(xì)胞變成癌癥或?qū)е缕渌膊 ?/p>
科學(xué)家現(xiàn)在可以使用稱為“單細(xì)胞 ATAC-seq”的尖端技術(shù)研究單個(gè)細(xì)胞內(nèi)的染色質(zhì)，但這會(huì)產(chǎn)生大量數(shù)據(jù)，包括大量噪音和偏差。Zang 的新工具解決了這一問(wèn)題，使科學(xué)家免于錯(cuò)誤的線索和浪費(fèi)的努力。
作為最好的時(shí)代，大規(guī)模的單細(xì)胞基因組學(xué)研究就像“大海撈針”，Zang 說(shuō)。但是他的新工具可以清理掉很多壞干草，從而使事情變得容易得多。
使用傳統(tǒng)的數(shù)據(jù)分析方法，您可能會(huì)看到一些看起來(lái)像特定染色質(zhì)狀態(tài)的真實(shí)信號(hào)的模式，但由于實(shí)驗(yàn)技術(shù)本身的偏差，它們實(shí)際上是假的。這種虛假信號(hào)會(huì)讓科學(xué)家感到困惑。我們開(kāi)發(fā)了一個(gè)模型來(lái)更好地捕獲和過(guò)濾掉這種虛假信號(hào)，這樣我們正在尋找的真針就可以更容易地從干草中脫穎而出。”
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