確定可以預(yù)測某些類型乳腺癌的新遺傳特征

研究人員已經(jīng)確定了一些具有乳腺癌預(yù)后價值的遺傳特征。這一發(fā)現(xiàn)也有助于更好地理解癌癥等疾病期間病理性血管生成、血管異常增生的分子機制。

這項發(fā)表在《PLOS Genetics》雜志上的研究結(jié)合了視網(wǎng)膜病變相關(guān)基因(作為血管生成模型)的研究，并分析了來自公共乳腺癌數(shù)據(jù)庫的轉(zhuǎn)錄組基因表達譜。

這項研究是由圣保羅大學(xué)化學(xué)研究所的研究人員與加拿大多倫多安大略癌癥研究所(OICR)合作進行的，并得到了圣保羅研究基金會-FAPESP的支持。

“我們已經(jīng)確定了一組基因，其在乳腺癌中的表達與腫瘤中病理性血管生成的程度有關(guān)。因此，鑒于先前發(fā)現(xiàn)的相關(guān)性，它可以用作血管生成的遺傳標記，這比先前鑒定的標記更具預(yù)后性和更強有力。血管生物學(xué)實驗室負責人、該研究的合著者、IQ-USP教授Ricardo Giordano說。

在這項研究中，巴西研究人員在健康和患病的小鼠視網(wǎng)膜中發(fā)現(xiàn)了153個改變的基因。他們從這個列表中鑒定出149個相同的人類基因。這些結(jié)果是與加拿大團隊合作進行的基因特征研究的基礎(chǔ)，該團隊使用了一個包含乳腺癌患者信息的數(shù)據(jù)庫。結(jié)論：就病理預(yù)后而言，參與病理性血管生成的11個關(guān)鍵基因是最好的。

病理性血管生成常見于乳腺癌和視網(wǎng)膜病變。USP生物信息學(xué)實驗室負責人Jo oCarlos Setubal說：“這兩種疾病共享這一過程，血管生成是癌癥發(fā)展的基礎(chǔ)這一事實促使我們試圖在視網(wǎng)膜病變和乳腺癌之間架起一座橋梁?！蔽恼碌暮现?。

據(jù)研究人員稱，這項研究主要針對乳腺癌，因為有大量關(guān)于這種疾病的可用數(shù)據(jù)。Setubal說：“鑒于一個患者和另一個患者之間的巨大差異，我們必須訪問大量公共數(shù)據(jù)。乳腺癌就是這種情況。基因圖譜可以用于大約2000名患者，”setubal說。

他補充說，生物信息學(xué)對于發(fā)現(xiàn)遺傳特征至關(guān)重要。與加拿大OICR的研究人員合作，將實驗室產(chǎn)生的數(shù)據(jù)提交給復(fù)雜的計算和處理。這項研究的另一位合著者、當時還是博士生的羅德里戈瓜里斯奇德索薩(Rodrigo Guarischi de Sousa)編寫了這個程序，并測試了149個人類基因，這些基因可能是乳腺癌特征的一部分。在這部分研究中，他得到了FAPESP獎學(xué)金的支持，這是一個由OICR的保羅布特羅斯指導(dǎo)的國外研究實習(xí)項目。

布特羅斯目前是加州大學(xué)洛杉磯分校人類遺傳學(xué)系的研究員。瓜里斯奇德索薩現(xiàn)在在巴西最大的醫(yī)療診斷公司DASA工作。

研究人員計劃找到這一特征的應(yīng)用，尤其是在乳腺癌的治療中。喬治達諾說：“我們的下一個目標是繼續(xù)研究癌癥中的血管生成?！薄拔覀冇信d趣確定這份清單中的基因，這些基因可以作為開發(fā)新藥或現(xiàn)有藥物的新應(yīng)用靶點。”

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