由阿克塞爾邁耶教授領(lǐng)導的康斯坦茨大學進化生物學家團隊發(fā)現(xiàn)了顏色模式反復進化的遺傳基礎(chǔ)。對檸檬科幾種東非魚類條紋的研究結(jié)果解釋了進化是如何以創(chuàng)紀錄的速度重演的。這項研究發(fā)表在10月26日的《科學》雜志上。
為什么進化會重演?在這些重復過程中,基因會發(fā)生什么?還是其他基因和機制可以產(chǎn)生看起來相似的生物?康斯坦茨大學的阿克塞爾邁耶教授和他的團隊接近回答這個問題,這個問題很重要,但仍然很重要。答案很神奇。他們研究了一種在各種動物中普遍存在的特殊顏色圖案:水平條紋。研究人員可以利用基因組學和分子生物學的現(xiàn)代方法來確定這些條紋重復進化的基礎(chǔ),并用帶有條紋的CRISPR-Cas突變魚進行驗證。
在馬拉維、維多利亞和坦甘吉卡等非洲湖泊中,可以發(fā)現(xiàn)1200多種色彩斑斕的美麗魚類。它們不僅色彩豐富,而且有許多彩色圖案,如水平或垂直條紋?!暗@還不是全部,”阿克塞爾邁耶解釋道。“cichlid是進化的主要例子。它們在社會行為、體型、色彩圖案和許多其他生物上極其多樣,但同時,一些特征在不同的湖泊中?!边@種重復進化的原理——生物學家稱之為收斂進化——使慈鯛成為研究這一現(xiàn)象的遺傳基礎(chǔ)的完美目標。如果相似的顏色和形狀出現(xiàn)在幾條獨立的進化線上,這意味著進化以同樣的方式對相似的環(huán)境條件做出反應?,F(xiàn)在的問題是:當進化重演時,這在遺傳中是如何起作用的?
現(xiàn)在,在實驗室里,通過基因組分析、育種和實驗,包括CRISPR-Cas作為“基因剪刀”,我們已經(jīng)重建了哪些基因和哪些遺傳機制在cichlid的條紋上起作用。邁耶斯教授團隊的早期專業(yè)研究員、科學研究的第一作者Claudius Kratochwil博士解釋說:“在育種實驗中,我們可以準確地確定22條染色體中的哪一條,甚至魚染色體的哪個區(qū)域,是條紋的基因指令。”與該染色體部分相關(guān)的基因稱為agrp2。這種“條紋基因”在其他非洲湖泊中的起源和分布已經(jīng)在比較分子研究中有所描述。從進化的角度來看,慈鯛的條紋相當不穩(wěn)定。在數(shù)百萬年的時間里,它們消失在非洲的湖泊中,并多次重現(xiàn)。因為這些物種(條紋和非條紋)太年輕了,它們可以在水族館里雜交。實驗室對條紋慈鯛和非條紋慈鯛的繁殖和檢驗表明,所有慈鯛都具有“條紋基因”。但是這個基因的開關(guān)(調(diào)控元件)是不同的。“這種基因轉(zhuǎn)化導致沒有條紋的物種的基因被激活。因此,產(chǎn)生了大量的蛋白質(zhì)?!被颉癮grp2”起“條紋抑制劑”的作用:基因產(chǎn)量高,條紋會被抑制,產(chǎn)量低,條紋會保留。研究人員可以通過現(xiàn)代基因方法證明這一點。“如果我們使用CRISPR-Cas從沒有條紋的物種的基因組中移除基因,”Kratochwil解釋說,“那么即使是“條紋”魚也會突然形成條紋,就像我們用CRISPR-Cas突變魚所展示的那樣。這證明了條紋基因是決定性的遺傳因素?!边@種基因轉(zhuǎn)換使得沒有條紋的物種的基因更加活躍。結(jié)果,產(chǎn)生了大量的蛋白質(zhì)?!皸l紋基因”agrp2充當“條紋抑制劑”:基因產(chǎn)量高,條紋會被抑制,產(chǎn)量低,條紋會保留。研究人員可以通過現(xiàn)代基因方法證明這一點?!叭绻覀兪褂肅RISPR-Cas從沒有條紋的物種的基因組中移除基因,”Kratochwil解釋道,“那么即使是沒有條紋的魚也會突然形成條紋,就像我們用CRISPR-Cas突變魚展示的那樣。條紋基因是決定性的遺傳因素?!边@種基因轉(zhuǎn)換使得沒有條紋的物種的基因更加活躍。結(jié)果,產(chǎn)生了大量的蛋白質(zhì)。“條紋基因”agrp2充當“條紋抑制劑”:基因產(chǎn)量高,條紋會被抑制,產(chǎn)量低,條紋會保留。研究人員可以通過現(xiàn)代基因方法證明這一點?!叭绻覀兪褂肅RISPR-Cas從沒有條紋的物種的基因組中移除基因,”Kratochwil解釋道,“那么即使是沒有條紋的魚也會突然形成條紋,就像我們用CRISPR-Cas突變魚展示的那樣。條紋基因是決定性的遺傳因素?!睏l紋將被抑制,如果輸出較低,它們將保留。研究人員可以通過現(xiàn)代基因方法證明這一點。“如果我們使用CRISPR-Cas從沒有條紋的物種的基因組中移除基因,”Kratochwil解釋道,“那么即使是沒有條紋的魚也會突然形成條紋,就像我們用CRISPR-Cas突變魚展示的那樣。條紋基因是決定性的遺傳因素?!睏l紋將被抑制,如果
產(chǎn)量低,它們將保留。研究人員能夠通過使用現(xiàn)代遺傳方法證明這一點。“如果我們使用CRISPR-Cas從沒有條紋的物種的基因組中去除基因,”Kratochwil解釋說,“那么即使是”無條紋“的魚也會突然形成條紋,正如我們用CRISPR-Cas突變體魚所展示的那樣。條紋基因是決定性的遺傳因素。“關(guān)于這種遺傳機制的最新發(fā)現(xiàn),“條紋基因”對條紋的激活或失活,發(fā)表在最新一期的“科學”雜志上。雜志。有趣的是,慈鯛的agrp2基因是哺乳動物中agouti基因的拷貝,它負責貓,狗,馬和條紋幼鳥的不同毛色。“沒有agouti基因家族,動物的世界可能會少得多,”Claudius Kratochwil反映道。相對而言,慈鯛中“條紋基因”的機制顯然可以在最短的時間內(nèi)實現(xiàn)重復進化。如果特征在進化過程中丟失,通常這種損失是永遠的,因為比利時古生物學家路易斯多洛已經(jīng)在125年前就已經(jīng)實現(xiàn)了,并在1893年的“玩偶法”中寫下了他的結(jié)論。條紋基因agrp2的特殊方面是它以簡單的方式重復演化特征。如果慈鯛丟失其條紋并不意味著它們永遠不會返回,反之亦然。這些分子生物學研究還表明,古生物學規(guī)則和進化規(guī)則必須再次受到質(zhì)疑。
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