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蛋白質可以幫助彼此與DNA結合

東京——東京都立大學的科學家們發(fā)現了一種獨特的機制,其中兩種轉錄因子在裂變酵母中穩(wěn)定彼此與 DNA 的結合。他們發(fā)現,當 Atf1 和 Rst2 靠得足夠近時,它們會幫助彼此穩(wěn)定地結合。它們都有助于轉錄一個處理葡萄糖貧乏環(huán)境但屬于完全獨立的激活途徑的基因。像這樣的新見解可以幫助科學家對抗癌癥。

DNA螺旋的流行圖片是一條長長的纏繞分子線,??包含創(chuàng)造和維持生命所需的所有信息。鮮為人知的是它如何整齊地包裝和儲存在細胞內:DNA 纏繞在稱為組蛋白的蛋白質結構周圍,形成一種稱為染色質的優(yōu)雅、緊密堆積的結構。為了讓分子過程實際使用該信息,染色質“打開”,使 DNA 可用于轉錄因子結合,這些蛋白質有助于將由堿基對(或“字母”)組成的 DNA 序列翻譯成信使 RNA(mRNA) .然后,該 mRNA 最終會被核糖體讀取,以根據原始藍圖生成蛋白質。

轉錄因子 (TF) 如何與染色質結合是生物醫(yī)學研究的重點。例如,許多癌癥的起源可以追溯到這個過程出錯的時候。由東京都立大學 Kouji Hirota 教授領導的團隊一直在研究這一過程,通過觀察一種更簡單的生物——裂殖酵母,重點研究它如何對環(huán)境變化做出反應?,F在,他們成功地瞥見了酵母細胞中轉錄如何響應周圍環(huán)境中缺乏葡萄糖的獨特機制。

當酵母細胞饑餓時,已知fbp1基因的轉錄被兩個 TF,Atf1 和 Rst2 大量激活。研究小組深入研究了這個過程,發(fā)現兩者的激活不僅對fbp1的功能至關重要,而且它們實際上有助于穩(wěn)定彼此。.他們能夠明確地表明,這在很大程度上要歸功于這些位點之間的距離有多近,通常僅相距 45 個堿基對。當在位點之間引入額外長度的 DNA 時,TF 突然無法相互幫助,染色質關閉,這兩個因素都不受約束。它們沿著螺旋的扭曲凹槽的相對方向也被證明是至關重要的。重要的是,這種效應已被證明足以抵消 Tup11 和 Tup12 的效應,這些共同抑制因子有助于破壞獨立 TF 與染色質的隨機結合。所有這些都表明,這種相互關系不僅有助于 TF 成功結合,而且還可以防止它們自身附著。

奇怪的是,這些 TF 是由完全獨立的化學途徑激活的。因此,該團隊發(fā)現的過程將這些路線整合到一個信號“樞紐”中。盡管在復雜的生化難題中是一個單一的部分,但這一發(fā)現有助于突出一種未被重視的機制,通過該機制,不同的 TF 相互作用并將途徑有效地整合在一起。該團隊希望這一新見解有助于對抗癌癥和其他相關疾病。

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